為促進(jìn)學(xué)術(shù)交流合作，推動百邁客生物多組學(xué)之——微生物組學(xué)在醫(yī)學(xué)、農(nóng)業(yè)等領(lǐng)域應(yīng)用與發(fā)展，將每周為大家分享微生物組學(xué)前沿研究熱點，涵蓋最新文獻(xiàn)和技術(shù)，關(guān)注微生物組與健康、疾病、環(huán)境等關(guān)系，為科研人員提供全面深入的微生物組學(xué)研究資訊。
【本期看點】
一、Signal Transduction and Targeted Therapy（IF 39.3）：腫瘤內(nèi)微生物群：癌癥發(fā)展和治療的新領(lǐng)域
二、Gut ( IF 24.5 ) :質(zhì)子泵抑制劑通過促進(jìn)口腔微生物群易位來改變腸道微生物群：一項前瞻性介入研究
三、Microbiome（IF 15.5）：揭示珍珠粟根系分泌物、微生物群和根鞘形成之間的相互作用
四、Water Research（IF 12.8）：聚乙烯微塑料引起的微生物變化影響沿海濕地沉積物垃圾分解過程中的溫室氣體排放
五、Science of the Total Environment（IF 9.8）：污染環(huán)境中腸道健康與腸道微生物群之間的關(guān)聯(lián)
Signal Transduction and Targeted Therapy（IF 39.3）：腫瘤內(nèi)微生物群：癌癥發(fā)展和治療的新領(lǐng)域
研究重點
人類微生物，包括細(xì)菌、真菌和病毒，在多種生理和病理過程中發(fā)揮著關(guān)鍵作用。一些研究發(fā)現(xiàn)，曾經(jīng)被認(rèn)為無菌的腫瘤組織實際上寄生著多種微生物，這些微生物已被證實與腫瘤發(fā)生密切相關(guān)。隨后提出了瘤內(nèi)微生物群的概念。微生物群作為腫瘤微環(huán)境的重要組成部分，可以通過黏膜破壞、鄰近組織遷移、血源性侵襲等方式定植腫瘤組織，影響腫瘤的生物學(xué)行為。機(jī)制研究表明，腫瘤內(nèi)微生物群可能通過誘導(dǎo)基因組不穩(wěn)定和突變、影響表觀遺傳修飾、促進(jìn)炎癥反應(yīng)、避免免疫破壞、調(diào)節(jié)代謝、激活侵襲和轉(zhuǎn)移來促進(jìn)腫瘤的發(fā)生和進(jìn)展。人類微生物，包括細(xì)菌、真菌和病毒，在多種生理和病理過程中發(fā)揮著關(guān)鍵作用。一些研究發(fā)現(xiàn)，曾經(jīng)被認(rèn)為無菌的腫瘤組織實際上寄生著多種微生物，這些微生物已被證實與腫瘤發(fā)生密切相關(guān)。隨后提出了瘤內(nèi)微生物群的概念。微生物群作為腫瘤微環(huán)境的重要組成部分，可以通過黏膜破壞、鄰近組織遷移、血源性侵襲等方式定植腫瘤組織，影響腫瘤的生物學(xué)行為。機(jī)制研究表明，腫瘤內(nèi)微生物群可能通過誘導(dǎo)基因組不穩(wěn)定和突變、影響表觀遺傳修飾、促進(jìn)炎癥反應(yīng)、避免免疫破壞、調(diào)節(jié)代謝、激活侵襲和轉(zhuǎn)移來促進(jìn)腫瘤的發(fā)生和進(jìn)展。
英文題目：Intratumoural microbiota: a new frontier in cancer development and therapy
作者：Yaqi Cao, Hui Xia, Xueyun Tan, Chunwei Shi, Yanling Ma, Daquan Meng, Mengmeng Zhou, Zhilei Lv, Sufei Wang, Yang Jin
DOI：10.1038/s41392-023-01693-0
Gut ( IF 24.5 ) :質(zhì)子泵抑制劑通過促進(jìn)口腔微生物群易位來改變腸道微生物群：一項前瞻性介入研究
研究重點
1、質(zhì)子泵抑制劑（PPI）降低了腸道微生物多樣性并改變了分類群；
2、腸道微生物群對人類健康至關(guān)重要，PPI給藥通過增加口腔源鏈球菌的腸道豐度來改變腸道微生物群 ，PPI促進(jìn)血管內(nèi)S. anginosus 向小鼠腸道的易位，漱口水降低了PPI給藥后腸道鏈球菌的豐
度；
3、動物模型和體外研究證實PPI使用者腸道中的細(xì)菌來源于口腔。
英文題目：Proton pump inhibitors alter gut microbiota by promoting oral microbiota translocation: a prospective interventional study
作者：Xue Xiao, Xian Zhang, Jin Wang, Yuqiang Liu, Hailin Yan, Xiaocun Xing,Jinlin Yang
DOI：10.1136/gutjnl-2023-330883
Microbiome（IF 15.5）：揭示珍珠粟根系分泌物、微生物群和根鞘形成之間的相互作用
研究重點
1、使用具有對比土壤聚集能力的四個不同品系研究了根系分泌物對珍珠粟中微生物群組成、相互作用和組裝過程以及根鞘結(jié)構(gòu)的影響；
2、利用 16S rRNA 基因和 ITS 元條形碼進(jìn)行微生物群分析，結(jié)合對不同植物區(qū)室和根系分泌物中代謝物組成的 FTICR-MS 代謝組學(xué)分析，揭示了微生物多樣性和相互作用網(wǎng)絡(luò)的巨大差異；
3、根組織 (RT) 和根附著土壤 (RAS) 的代謝特征反映了它們的土壤聚集水平，強調(diào)了植物固有性狀對微生物群組成以及 RT 和滲出液中獨特代謝特征的影響；
4、抗菌化合物（包括 DIMBOA 和 H-DIMBOA）出現(xiàn)在根系分泌物和低聚集系的 RT 中。這項研究強調(diào)了根系分泌物在塑造整個珍珠粟品系中與根部相關(guān)的微生物群組成方面的關(guān)鍵影響，與其土壤聚集能力密切相關(guān)，加深了對土壤-植物-微生物相互作用和塑造根際微生物群落的生態(tài)過程的認(rèn)識。
英文題目：Unraveling the interplay between root exudates, microbiota, and rhizosheath formation in pearl millet
作者：Abdelrahman Alahmad, Mourad Harir, Sylvain Fochesato, Joris Tulumello, Alesia Walker, Mohamed Barakat, Papa Mamadou Sitor Ndour, Philippe Schmitt-Kopplin, Laurent Cournac,
Laurent Laplaze, Thierry Heulin, Wafa Achouak
DOI：10.1186/s40168-023-01727-3
Water Research（IF 12.8）：聚乙烯微塑料引起的微生物變化影響沿海濕地沉積物垃圾分解過程中的溫室氣體排放
研究重點
1、探討了聚乙烯微塑料（PE-MP）影響沿海沉積物垃圾分解過程中溫室氣體（即CO2、CH4和N2O）排放的微生物機(jī)制；
2、在凋落物分解過程中，PE-MP暴露使累積CH4和CO2排放量分別顯著降低了41.07%和25.79%。然而， PE-MP暴露下累積N2O排放量沒有顯著變化；
3、隨著時間的推移，沉積物中的細(xì)菌、古菌和真菌群落對 PE-MP 暴露表現(xiàn)出不同的反應(yīng)，這反映在微生物群結(jié)構(gòu)的改變和功能組的改變上。由于 PE-MP 暴露和沉積物性質(zhì)變化而改變的微生物功能群可能有助于抑制凋落物分解過程中的 CH4和CO2排放。
英文題目：Polyethylene microplastic-induced microbial shifts affected greenhouse gas emissions during litter decomposition in coastal wetland sediments
作者：Simin Wang, Qixing Zhou, Xiangang Hu, Zongxin Tao
DOI：10.1016/j.watres.2024.121167
Science of the Total Environment（IF 9.8）：污染環(huán)境中腸道健康與腸道微生物群之間的關(guān)聯(lián)
研究重點
1、對暴露于放射性核素污染的野生動物種群的腸道微生物群和驅(qū)動腸道健康的宿主健康方面進(jìn)行了全面調(diào)查；
2、證明暴露于放射性核素與腸道微生物群組成的變化有關(guān)，腸道菌群的變化與野生田鼠腸道健康的改變有關(guān)；
3、息在受污染環(huán)境可能對動物腸道健康產(chǎn)生廣泛影響，提示在生態(tài)毒理學(xué)研究中應(yīng)同時考慮腸道健康和腸道微生物組。
英文題目：Association between gut health and gut microbiota in a polluted environment
作者：Toni Jernfors, Anton Lavrinienko, Igor Vareniuk, Rikard Landberg, Rikard Fristedt, Olena Tkachenko, Sara Taskinen, Eugene Tukalenko, Tapio Mappes, Phillip C. Watts
DOI：10.1016/j.scitotenv.2023.169804
百邁客云交互式更新7項分析內(nèi)容，宏基因組交互式同步更新中
百邁客云微生物多樣性APP新增7項圖片交互式功能，內(nèi)容包括Beta多樣性分析中的PLS-DA分析，microPITA分析、功能預(yù)測分析（PICRUSt2功能預(yù)測、BugBase表型預(yù)測、Tax4Fun功能預(yù)測、FAPROTAX功能預(yù)測），百邁客云宏基因組APP也將同步更新中……
功能預(yù)測柱狀圖
PLS-DA分析散點圖
microPITA分析散點圖
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