MuMADS1 和 MaOFP1在番茄ovate突變體中調(diào)控果實(shí)品質(zhì)的形成

作者之前已經(jīng)證明香蕉OFP促進(jìn)果實(shí)成熟。香蕉中OFP1（MaOFP1）與MADS-box蛋白MuMADS1相互作用對(duì)于香蕉采后乙烯促進(jìn)成熟產(chǎn)生拮抗作用。然后，香蕉果實(shí)的成熟過(guò)程也成為果實(shí)質(zhì)量的一個(gè)部分。MuMADS1和MaOFP1果實(shí)品質(zhì)形成方面，是否有的新的作用，目前尚不清楚。
本篇文章以野生型、突變體番茄、三種不同轉(zhuǎn)基因系M（過(guò)表達(dá)MuMADS1）、O（過(guò)表達(dá)MaOFP1）、MO（同時(shí)過(guò)表達(dá)MuMADS1和MaOFP1）為實(shí)驗(yàn)材料，運(yùn)用轉(zhuǎn)錄組測(cè)序技術(shù)，解析了MuMADS1和MaOFP1對(duì)果實(shí)品質(zhì)形成方面的分子機(jī)制。

研究結(jié)果

（1）差異表達(dá)基因（DEGs）數(shù)目分析

下圖表明了MuMADS1 和 MaOFP1能調(diào)節(jié)突變體中差異基因數(shù)目

(a) WT vs. ovate; (b) WT vs. MuMADS1 transformants; (c) WT vs. MaOFP1 transformants; (d) WT vs.
MuMADS1 + MaOFP1 transformants; (e) ovate vs. MuMADS1 transformants; (f) ovate vs. MaOFP1 transformants; (g) ovate vs. MuMADS1 + MaOFP1
transformants.

（2）差異基因的功能注釋和富集分析

COG分類表明淀粉、蔗糖和碳代謝構(gòu)成了外源基因整合最主要的代謝途徑，這些基因可能是果實(shí)品質(zhì)形成期活躍的基因。

Histogram of COG classifification.
(a) WT vs. ovate; (b) WT vs. MuMADS1 transformants; (c) WT vs. MaOFP1 transformants; (d) WT vs.
MuMADS1 + MaOFP1 transformants; (e) ovate vs. MuMADS1 transformants; (f) ovate vs. MaOFP1 transformants; (g) ovate vs. MuMADS1 + MaOFP1
transformants.

本文通過(guò)轉(zhuǎn)錄組差異基因數(shù)據(jù)分析及通路注釋，解析了MuMADS1和 MaOFP1共同調(diào)控果實(shí)品質(zhì)的性狀的分子機(jī)制。類似的分析內(nèi)容在轉(zhuǎn)錄組相關(guān)文獻(xiàn)中已成為標(biāo)準(zhǔn)必備。百邁客云平臺(tái)（BMKCloud）基于此，已開(kāi)發(fā)了一系列測(cè)序數(shù)據(jù)分析平臺(tái)，涵蓋多個(gè)研究方向。

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1、導(dǎo)入數(shù)據(jù)

2、點(diǎn)擊提交

3、圖形優(yōu)化

 

百邁客云除可實(shí)現(xiàn)以上文章中圖表之外，還可以免費(fèi)利用在線工具制作百余種RNA-Seq測(cè)序分析結(jié)果繪制圖（部分案例）：

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二、成功案例：

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