活動(dòng)日程
百邁客三代測(cè)序 服務(wù)再創(chuàng)輝煌
HiFi模式由于其長(zhǎng)讀長(zhǎng)、高準(zhǔn)確性等特點(diǎn)，已在多個(gè)研究方向有大量的應(yīng)用?；赑acBio Revio測(cè)序平臺(tái)，百邁客將繼續(xù)在動(dòng)植物基因組測(cè)序、全長(zhǎng)轉(zhuǎn)錄組測(cè)序、微生物真細(xì)菌測(cè)序、宏基因組研究、甲基化研究、結(jié)構(gòu)變異、微生物擴(kuò)增子全長(zhǎng)等方向提供優(yōu)質(zhì)的服務(wù)，未來(lái)也將在單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組的領(lǐng)域上“大展拳腳”。
PacBio?Revio HiFi數(shù)據(jù)應(yīng)用方向
基因組（Denovo Sequencing），即基因組從頭測(cè)序，指在不依賴參考基因組的情況下繪制該物種的全基因組序列圖譜，從而獲取該物種的全部遺傳信息。在已知基因組大小，或者有調(diào)研圖結(jié)果的情況下，基于PacBio?Revio測(cè)序平臺(tái)進(jìn)行測(cè)序，進(jìn)行基因組組裝和基本分析，獲得高質(zhì)量基因組序列，為該物種的后基因組學(xué)、分子育種、環(huán)境適應(yīng)等方面研究奠定基礎(chǔ)。并且，隨著對(duì)基因組更高質(zhì)量的追求，單一材料的基因組無(wú)法涵蓋該物種的所有遺傳信息等，對(duì)泛基因組、T2T基因組、單倍型基因組的構(gòu)建也越來(lái)越成為基因組研究的熱點(diǎn)！
全基因組重測(cè)序（Resequencing）是對(duì)已知基因組序列的物種進(jìn)行不同個(gè)體的二代或三代基因組測(cè)序，并在此基礎(chǔ)上對(duì)個(gè)體或者群體進(jìn)行變異檢測(cè)分析。結(jié)構(gòu)變異（SVs）指長(zhǎng)度大于50bp的大片段結(jié)構(gòu)變異，包括許多類型，如缺失（DEL）、插入（INS）、重復(fù)（DUP）和倒位（INV）等，它們?cè)趥€(gè)體和群體水平上促進(jìn)了人類、動(dòng)植物基因組的多樣性和進(jìn)化。并且越來(lái)越多的證據(jù)表明，SVs與許多動(dòng)植物農(nóng)藝性狀（如抗病性、產(chǎn)量性狀等）及人類疾病（如神經(jīng)發(fā)育疾病、心血管疾病和癌癥等）相關(guān)。相較于二代測(cè)序，基于PacBio Revio三代測(cè)序可以提高SVs檢測(cè)的靈敏度，提供了豐富的變異信息，并且，PacBio Revio通量更高，成本更低，能夠更全面地從群體層面理解遺傳變異及其與人類疾病/動(dòng)植物表型之間的關(guān)系。
隨著高通量測(cè)序的發(fā)展，轉(zhuǎn)錄組測(cè)序（RNA-seq）已經(jīng)成為研究基因表達(dá)調(diào)控的主要手段。二代測(cè)序技術(shù)通量高，更多的關(guān)注基因表達(dá)量，然而其局限性在于測(cè)序讀長(zhǎng)短，轉(zhuǎn)錄本產(chǎn)生拼接錯(cuò)誤，導(dǎo)致轉(zhuǎn)錄本結(jié)構(gòu)不完整。而生物體內(nèi)復(fù)雜多變的轉(zhuǎn)錄本是調(diào)節(jié)基因表達(dá)和蛋白質(zhì)多樣性的重要機(jī)制，準(zhǔn)確鑒定轉(zhuǎn)錄本結(jié)構(gòu)，是深入研究基因表達(dá)調(diào)控模式的基礎(chǔ)?？刹捎?strong>PacBio Revio測(cè)序平臺(tái)，借助其長(zhǎng)讀長(zhǎng)優(yōu)勢(shì)，無(wú)需組裝，直接獲得全長(zhǎng)轉(zhuǎn)錄本。
宏基因組學(xué)（Metagenomics）是對(duì)環(huán)境樣本中（土壤、糞便等）微生物總DNA進(jìn)行測(cè)序。關(guān)注環(huán)境微生物群體種群結(jié)構(gòu)、進(jìn)化分析、功能基因；解析微生物功能與環(huán)境之間的關(guān)系；挖掘和研究特定功能基因及代謝通路?；?strong>PacBio Revio測(cè)序能夠?qū)Νh(huán)境樣本進(jìn)行微生物組分析，組裝重復(fù)的基因組區(qū)域、提供宏基因組物種鑒定的準(zhǔn)確度、獲得更多低豐度物種。另外，基于PacBio Revio進(jìn)行全長(zhǎng)微生物多樣性測(cè)序技術(shù)，兼顧了長(zhǎng)讀長(zhǎng)和準(zhǔn)確性高的優(yōu)勢(shì)，可直接獲得真正準(zhǔn)確到“種”的分類鑒定，可以更加真實(shí)地還原樣本中微生物的群落結(jié)構(gòu)。
表觀遺傳學(xué)（Epigenetics）是指基于非基因序列改變所致基因表達(dá)水平的改變。DNA甲基化是表觀遺傳的經(jīng)典修飾方式，在調(diào)控基因表達(dá)、維持染色質(zhì)結(jié)構(gòu)、基因印記、X染色體失活以及胚胎發(fā)育等生物學(xué)過(guò)程中發(fā)揮著重大的作用。DNA甲基化的形式多樣，主要包括C5-甲基胞嘧啶（5mC）、N6-甲基腺嘌呤（6mA）等。目前市場(chǎng)常用重亞硫酸鹽法檢測(cè)5mC，其準(zhǔn)確度高，但化學(xué)處理會(huì)導(dǎo)致DNA分子的片段化、測(cè)序深度高、無(wú)法鑒定更多修飾類型?；?strong>PacBio Revio測(cè)序平臺(tái)可在不依賴DNA實(shí)驗(yàn)處理的情況下，根據(jù)信號(hào)差來(lái)識(shí)別甲基化位點(diǎn)信息。
百邁客青島實(shí)驗(yàn)室中現(xiàn)已有十余臺(tái)PacBio?測(cè)序儀，結(jié)合Revio的引進(jìn)和使用，百邁客將進(jìn)一步提升三代測(cè)序服務(wù)產(chǎn)品，致力于提供全面而可靠的服務(wù)。讓我們一起期待！
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