年度盤點(diǎn)|2022年百邁客單細(xì)胞&空間組學(xué)扶搖直上

白駒過隙,時(shí)光荏苒。2022年百邁客突破國(guó)外技術(shù)壟斷，推出百創(chuàng)系列產(chǎn)品，提供植物單細(xì)胞測(cè)序新方案，打造單細(xì)胞&空間個(gè)性化交互式分析，成功助力蝴蝶蘭花器官時(shí)空?qǐng)D譜國(guó)內(nèi)首秀，積累了豐富的項(xiàng)目經(jīng)驗(yàn)。接下來，讓我們一起來看看今年百邁客在單細(xì)胞&空間組學(xué)上有哪些突破。

百創(chuàng)智造，破界而出

百創(chuàng)DG1000突破直徑壁壘：為了突破單細(xì)胞試劑耗材及儀器長(zhǎng)期以來的國(guó)外技術(shù)壟斷，降低單細(xì)胞應(yīng)用的成本，突破主流平臺(tái)40μm細(xì)胞直徑限制，滿足更多的單細(xì)胞場(chǎng)景需求。經(jīng)過潛心研發(fā)，百邁客發(fā)布了自主研發(fā)的單細(xì)胞微液滴系統(tǒng)-百創(chuàng)DG1000。

百創(chuàng)S1000亞細(xì)胞級(jí)分辨率：今年由百創(chuàng)智造推出亞細(xì)胞級(jí)別空間轉(zhuǎn)錄組測(cè)序技術(shù)，不僅打破了國(guó)外芯片技術(shù)的壟斷，還突破了分辨率和檢測(cè)通量的局限，支持100μm ~5μm多級(jí)分辨率分析。成為“亞細(xì)胞級(jí)分辨率”和“微孔”結(jié)合的原位捕獲空間轉(zhuǎn)錄組測(cè)序技術(shù)，全面邁入國(guó)產(chǎn)化空間轉(zhuǎn)錄組的亞細(xì)胞技術(shù)時(shí)代。

百創(chuàng)S1000-Nanopore空間全長(zhǎng)轉(zhuǎn)錄組：今年百創(chuàng)智造發(fā)布了百創(chuàng)S1000-Nanopore空間全長(zhǎng)轉(zhuǎn)錄組產(chǎn)品。經(jīng)過不斷研發(fā)測(cè)試，百創(chuàng)S1000不僅解決了分辨率低、成本高等難題，其獨(dú)立設(shè)計(jì)的SpatialBarcode還可以高度適配ONT平臺(tái)，獲得的有效數(shù)據(jù)量得到了大幅提高，為廣大科研人員和臨床工作者開展發(fā)育、腫瘤、免疫、神經(jīng)等一系列研究和應(yīng)用提供了新思路。

多種方案，隨心挑選

百邁客植物單細(xì)胞核轉(zhuǎn)錄組技術(shù)（snRNA-seq），無需進(jìn)行原生質(zhì)體的制備，在保證高效捕獲分選單細(xì)胞核轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)的同時(shí)，減少了應(yīng)激基因表達(dá)影響、胞質(zhì)內(nèi)代謝物的干擾，并可兼容更大細(xì)胞直徑，獲得更全面信息。也為特殊樣本進(jìn)行單細(xì)胞測(cè)序提供了新的解決方案，為進(jìn)一步推動(dòng)植物單細(xì)胞研究提供重要的技術(shù)支撐。

個(gè)性化云交互，自主探索更多可能

百邁客研發(fā)團(tuán)隊(duì)全力打造的單細(xì)胞&空間轉(zhuǎn)錄組個(gè)性化交互平臺(tái)，專為解決廣大客戶的個(gè)性化分析問題而生，分析參數(shù)隨心更改、分析不限次數(shù)，省時(shí)省力，高效完成交互式分析。

單細(xì)胞個(gè)性化交互云平臺(tái)

可自主進(jìn)行細(xì)胞過濾、細(xì)胞聚類、maker基因分析、細(xì)胞注釋、差異分析等交互式分析。

空間轉(zhuǎn)錄組交互式云平臺(tái)

可自主進(jìn)行spot數(shù)據(jù)過濾、多樣本整合分析、降維聚類分析、基于目標(biāo)區(qū)域的差異基因分析等步驟。

交互式軟件，便于可視化分析

百邁客自主研發(fā)的多級(jí)分辨率可視化工具–Spatial Tools，該工具可以進(jìn)行自定義展示HE圖、全局聚類圖、目標(biāo)cluster聚類圖、單細(xì)胞聯(lián)合空間細(xì)胞類型注釋分布圖。針對(duì)感興趣的區(qū)域，可以使用選框或套索工具獲取目標(biāo)區(qū)域的barcode列表，自定義配色、透明度、標(biāo)題、圖例調(diào)整等，分析內(nèi)容更加貼近實(shí)際所需，交互式功能十分強(qiáng)大。

助力蝴蝶蘭時(shí)空?qǐng)D譜國(guó)內(nèi)首秀

影響因子：19.160

發(fā)表單位：復(fù)旦大學(xué)與江西農(nóng)業(yè)大學(xué)

百邁客提供服務(wù)：10x Visium空間轉(zhuǎn)錄組技術(shù)

研究?jī)?nèi)容：利用10x Visium空間轉(zhuǎn)錄組學(xué)數(shù)據(jù)分析了蝴蝶蘭花器官早期發(fā)育過程中基因表達(dá)的動(dòng)態(tài)變化。通過對(duì)時(shí)空表達(dá)分布的比較，確定了在特定組織/階段優(yōu)先表達(dá)的數(shù)千個(gè)基因，包括MADS-box基因和許多其他潛在下游基因，形成了花器官初始化、身份決定和形態(tài)建成的模型。對(duì)蘭花開花發(fā)育過程進(jìn)行了系統(tǒng)的研究，為進(jìn)一步研究蘭花開花過程中復(fù)雜而重要的基因調(diào)控網(wǎng)絡(luò)提供了寶貴的資源。

百邁客項(xiàng)目經(jīng)驗(yàn)分享

?目前百邁客單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組已完成動(dòng)植物物種50+類，組織類型250+種。空間轉(zhuǎn)錄組已在100余種不同物種組織類型中得到驗(yàn)證，突破了軟骨、血管、皮膚、花苞、幼芽等疑難樣本切片透化的難點(diǎn)攻克，積累了豐富的項(xiàng)目經(jīng)驗(yàn)。

尾聲

凡是過往，皆為序章。直掛云帆，乘風(fēng)破浪。2023我們將砥礪前行，共話新篇章!