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發(fā)布于 2019年1月25日

（百邁客CEO鄭洪坤先生等與Oxford Nanopore 商業(yè)運營副總裁Richard等合影）

2019年1月23日，Oxford Nanopore Technology公司（以下簡稱ONT）技術團隊再次來訪北京百邁客生物科技有限公司，并就ONT平臺發(fā)展，公司戰(zhàn)略等進行深入的合作交流。此次來訪，ONT技術人員宣布：當前用戶中，PromethION單Cell產出記錄由百邁客產生（162 Gb/Cell）！

Nanopore平臺是新興的實時單分子納米孔測序技術平臺：借助單個分子通過納米孔時引起孔兩側電位差來實現(xiàn)信號檢測，納米孔的直徑僅允許單個核苷酸聚合物通過，而ATCG四種堿基的帶電性質不同，因此通過電信號差異特征即可檢測出通過納米孔的堿基類型，從而實現(xiàn)測序。

慕然回首，距離百邁客開啟Nanopore研發(fā)項目已經近2年時間，各方面的技術與平臺服務已經十分成熟當前已經有3臺ONT測序通量的PromethION在百邁客投產（了解詳情）。

關于平臺是否好用？技術是否成熟？項目經驗豐富嗎？百邁客實力究竟如何？關心的物種有沒有參考指標？想必大家非常感興趣，有非常多的信息需要了解！為了讓廣大用戶了解百邁客在ONT平臺上的實力，小編將不定期開發(fā)ONT平臺的數(shù)據(jù)產出情況。

2019年1月下機數(shù)據(jù)（部分）

注：Species：分析的物種信息；SeqNum：各個長度范圍內序列的數(shù)目；SumBase：指各個長度范圍內序列的總長度；N50Len：reads N50長度；N90Len：readsN90長度；MeanLen：平均reads長度；MaxLen：最長reads長度；MeanQual：質量值，準確度=1-10^(-Q/10)。

數(shù)據(jù)顯示，目前reads N50幾乎均在25 Kb以上，平均Reads N50達到了35 Kb?以上！最長reads N50高達52.8 Kb，最長Reads更是高達1.6 Mb,質量值也幾乎都維持在8以上（堿基準確率~85 %）。PS: 這里的堿基準確率是指未經過糾錯與polish的數(shù)據(jù)。當組裝后經過糾錯與polish之后，堿基的準確度均在99.99%以上。之前小編已經給大家科普過！

如果大家了解三代主流的組裝方法的話，相信大家一定知道，數(shù)據(jù)越長，對組裝的幫助越大。小編截獲的數(shù)據(jù)相應的組裝情報如下

2019年1月組裝數(shù)據(jù)（部分）

注：Species：分析的物種信息；CtgNum：contig數(shù)目；CtgLen：contig總長度；CtgN50：contigN50長度；CtgN90：contigN90長度；CtgMax：最長contig長度。

ContigN50是衡量基因組組裝好壞的一個重要指標，一定程度上來說，contigN50值越高表示組裝的質量越好。組裝數(shù)據(jù)表中，ONT的組裝數(shù)據(jù)中contigN50水平均在1 Mb以上（測序深度的高低會有一定的影響，為了更好組裝指標，一般建議進行100X以上），雜合度高的物種組裝結果同樣會略遜色于其它簡單物種。相較之前最強水產組裝結果（N50>22 Mb），ONT作物組裝N50最高值再創(chuàng)新高，達到了27 Mb?。?span style="color: #3366ff;">數(shù)據(jù)評估結果點擊查看）不管大家怎么看，反正小編被如此高的指標深深的震撼了，希望技術團隊再接再厲，創(chuàng)造新的記錄！

好啦，今天的介紹到此為止，欲知后事如何，且聽小編下回分曉！

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