如何7天做完一個(gè)非靶向代謝組學(xué)分析？

非靶向代謝組(untargeted metabolomics)是一種常用廣泛篩選的代謝物的的代謝組學(xué)研究方法，作為表觀的最直接體現(xiàn)者，近年來來一直深受各位學(xué)者的追捧。隨著檢測(cè)技術(shù)手段的不斷升級(jí)，為了提供更好更高質(zhì)量的代謝組學(xué)數(shù)據(jù)，?不斷的加大研發(fā)的力度，提升非靶向代謝組的檢測(cè)質(zhì)量，以挖掘到樣本中更多更準(zhǔn)代謝物信息，如何在7天內(nèi)快速做完一個(gè)非靶向代謝組的項(xiàng)目？

選用超優(yōu)的平臺(tái)

首先要選用高分辨Water Q-TOF質(zhì)譜平臺(tái)和成熟穩(wěn)定的質(zhì)控體系，提供準(zhǔn)確優(yōu)質(zhì)數(shù)據(jù)，平臺(tái)特點(diǎn)：

• 雙離子ESI源，專利LockSpray實(shí)時(shí)在線矯正技術(shù)（高穩(wěn)定性）—數(shù)據(jù)可靠
• StepWave 技術(shù)，保證滿足痕量檢測(cè)的要求（高靈敏度）—低豐度物質(zhì)（新物質(zhì)，不曾報(bào)道的，好發(fā)文章）

超全的數(shù)據(jù)庫

欲善其事必先利其器，數(shù)據(jù)庫是代謝物定性的根本利器，百邁客對(duì)本地?cái)?shù)據(jù)庫不斷升級(jí)擴(kuò)大，升級(jí)后本地?cái)?shù)據(jù)庫物質(zhì)5000+代謝物，自建庫在行業(yè)中位居前列。

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畫圖工具

文獻(xiàn)里面好看又直觀的的美圖是如何制作出來噠？比如韋恩圖、箱形圖等。這就需要用到一些畫圖工具，這里推薦百邁客云在線分析工具，百邁客云有104款分析小工具，涵蓋基因分析、遺傳進(jìn)化、ncRNA、質(zhì)控、組裝、比對(duì)、數(shù)據(jù)提取、突變、統(tǒng)計(jì)、表格處理、繪圖、序列分析等12大功能，非常齊全。

代謝組可以反映生物體表型的狀態(tài)變化。代謝組與轉(zhuǎn)錄組、蛋白組的多組學(xué)聯(lián)合分析可以同時(shí)實(shí)現(xiàn)從多個(gè)層面來探究生物學(xué)問題，相互間進(jìn)行驗(yàn)證，從海量的數(shù)據(jù)中篩選出關(guān)鍵基因、蛋白質(zhì)及代謝通路，解釋生物過程的復(fù)雜性和整體性，提高文章的水平。下面為大家推薦幾篇代謝組多組學(xué)聯(lián)合分析的文獻(xiàn)。

案例一

期刊：Journal of Hazardous Materials

IF：14.224

單位：河南科技學(xué)院?河南農(nóng)業(yè)大學(xué)

研究方法：代謝組學(xué)?轉(zhuǎn)錄組學(xué) 蛋白質(zhì)組學(xué)

案例二

期刊：Frontiers in Plant Science

IF：6.627

單位：黑龍江八一龍墾大學(xué)

研究方法：非靶代謝組學(xué)+轉(zhuǎn)錄組學(xué)

案例三

單位：西南大學(xué)

期刊：Environmental and Experimental Botany

IF:6.028

研究策略：轉(zhuǎn)錄組 +代謝組+ICP-MS離子組學(xué)

案例四

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單位：中國(guó)科學(xué)院西北生態(tài)環(huán)境資源研究所

期刊：International Journal of Molecular Sciences

IF:4.556

研究策略：微生物組學(xué) +代謝組學(xué)

案例五

單位：四川農(nóng)業(yè)大學(xué)

期刊：Frontiers in Plant Science

IF:6.627

研究策略：轉(zhuǎn)錄組學(xué) +代謝組學(xué)

案例六

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單位：甘肅農(nóng)業(yè)大學(xué)

期刊：Frontiers in Microbiology

IF:6.064

研究策略：轉(zhuǎn)錄組學(xué) +代謝組學(xué)+微生物組學(xué)

案例七

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單位：石河子大學(xué)

期刊：Frontiers in Plant Science

IF:6.627

研究策略：轉(zhuǎn)錄組學(xué) +代謝組學(xué)+微生物組學(xué)

案例八

單位：新鄉(xiāng)醫(yī)學(xué)院

期刊：Science of the Total Environment

IF:10.753

研究策略：微生物多樣性+代謝組

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百邁客生物代謝組項(xiàng)目?jī)?yōu)勢(shì)

超廣項(xiàng)目經(jīng)驗(yàn)

百邁客近一年已完成非靶代謝組項(xiàng)目經(jīng)驗(yàn)2w+，為使老師更直觀的認(rèn)知百邁客非靶向代謝組產(chǎn)品，我們對(duì)2022年300多個(gè)項(xiàng)目數(shù)據(jù)進(jìn)行了統(tǒng)計(jì)，包含物種信息、樣本類型及檢出通量。

• 超全樣本類型

物種類型涵蓋豐富，包括動(dòng)物，植物，微生物，細(xì)胞類型樣本，小編整理一下近半年的部分樣本類型展示如下表。

• 超高檢測(cè)通量

小編統(tǒng)計(jì)了2022年近兩個(gè)月的植物樣本的非靶物質(zhì)檢出情況，植物樣本中二級(jí)鑒定到的物質(zhì)數(shù)量最高4700，平均檢出3199個(gè)物質(zhì)，隨后隨機(jī)抽取了20個(gè)項(xiàng)目，涉及不同物種，針對(duì)植物樣本中二級(jí)鑒定到的物質(zhì)數(shù)目，繪制成了以下：

超高檢測(cè)穩(wěn)定性

小編對(duì)部分植物項(xiàng)目的檢出情況進(jìn)行了歸納，得到了各個(gè)檢出水平的項(xiàng)目占比，具體如下圖：

從圖可以看到植物樣本，85%以上的項(xiàng)目二級(jí)檢出物質(zhì)數(shù)均在2000+個(gè)以上，65%以上的項(xiàng)目二級(jí)檢出物質(zhì)數(shù)均在3000個(gè)以上，通過這些項(xiàng)目實(shí)測(cè)數(shù)據(jù)足以看出，百邁客非靶產(chǎn)品對(duì)代謝物鑒定具有強(qiáng)大檢測(cè)能力！

?超全物質(zhì)覆蓋度

非靶向代謝組學(xué)技術(shù)無偏向性捕獲代謝物數(shù)據(jù)，小編統(tǒng)計(jì)了部分項(xiàng)目，主要檢出類別如下表：

百邁客開學(xué)季活動(dòng)火熱進(jìn)行中，開學(xué)鉅惠！

 

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