CircRNA是真核生物中共價(jià)封閉的內(nèi)源性生物分子，具有組織特異性和細(xì)胞特異性的表達(dá)特點(diǎn)。其來(lái)源方式多樣，不易受RNA外切酶影響,表達(dá)更穩(wěn)定,不易降解，許多circRNA可通過(guò)充當(dāng)microRNA的“海綿”或某些蛋白質(zhì)的抑制劑，從而阻斷miRNA對(duì)靶基因的抑制作用，同時(shí)調(diào)控其他類(lèi)型RNA的表達(dá)，circRNA一直是科研人員關(guān)注的熱點(diǎn)研究之一，并且隨著CircRNA的編碼能力的發(fā)現(xiàn)，circRNA的研究更是吸引了大家的目光。
近期，Nature發(fā)表了一篇關(guān)于真核生物中的CircRNA研究發(fā)展的評(píng)論（Widespread occurrence of circular RNA in eukaryotes），文章中介紹了從在20世紀(jì)70年代末到當(dāng)前CircRNA的主要發(fā)展節(jié)點(diǎn)，從80年代，CircRNAs被認(rèn)為起源于RNAs的副產(chǎn)物，到2013年，《自然》雜志同一期的兩篇文章報(bào)道了真核生物中數(shù)千個(gè)含有外顯子序列的CircRNAs，再到Memczak和Rajewsky等人的論文揭示了CircRNA參與的復(fù)雜調(diào)控網(wǎng)絡(luò)，CircRNA的研究一直在如火如荼的進(jìn)行中。據(jù)不完全統(tǒng)計(jì)，僅2020年已發(fā)表的circRNA相關(guān)文章，影響因子大于10的文章有99篇，5~10的文章有324篇，小于5的文章1468篇！特別是影響因子>10的CircRNA文章數(shù)量相比之前的五年有明顯增長(zhǎng)。
百邁客生物作為國(guó)內(nèi)轉(zhuǎn)錄組學(xué)研究的先行者，不僅對(duì)于線性RNA的研究經(jīng)驗(yàn)豐富，在非編碼RNA的研究方向上也身經(jīng)百戰(zhàn)，涉及覆蓋動(dòng)物、植物、真菌等近百個(gè)物種類(lèi)型，為了方便客戶(hù)的數(shù)據(jù)挖掘，同時(shí)也配備了專(zhuān)業(yè)完善的分析平臺(tái)，今天就要向各位宣布一個(gè)好消息，CircRNA的個(gè)性化上線啦！
一、基因查找不費(fèi)勁
CircRNA的功能分析主要依靠于來(lái)源基因的功能注釋?zhuān)绾卧诤Ａ康臄?shù)據(jù)中直接找到關(guān)心的目的基因呢?首先就是根據(jù)功能注釋進(jìn)行檢索，百邁客云平臺(tái)的CircRNA分析平臺(tái)中，支持針對(duì)結(jié)果根據(jù)八大功能數(shù)據(jù)庫(kù)的注釋信息批量檢索相關(guān)注釋基因、并且批量提取相關(guān)信息；靶向關(guān)系的預(yù)測(cè)也是關(guān)鍵circRNA檢索的必要一步，CircRNA分析平臺(tái)同時(shí)支持通過(guò)miRNA的ID批量提取相關(guān)靶向的CircRNA信息，此外，CircRNA ID、來(lái)源基因ID、來(lái)源基因name等功能，通過(guò)上傳ID文件均可實(shí)現(xiàn)批量查詢(xún)，甚至可以批量下載序列文件，省去多個(gè)文件來(lái)回切換的繁雜操作，一鍵式提取關(guān)鍵信息！
二、功能注釋富集分析信手拈來(lái)
CircRNA的調(diào)控作用深度挖掘離不開(kāi)功能富集分析，研究角度的多樣、篩選條件的調(diào)整直接導(dǎo)致圖形繪制的重復(fù)工作量，為了讓老師們不再為美觀多樣的富集圖繪制而感到頭禿，CircRNA云平臺(tái)支持多種富集圖在線繪制，無(wú)需整理復(fù)雜多樣的輸入文件，無(wú)需學(xué)習(xí)晦澀難懂的生信語(yǔ)言，無(wú)論怎么調(diào)整基因集合，只需要一個(gè)點(diǎn)擊，美觀準(zhǔn)確的八大類(lèi)型富集圖即刻獲得?。ㄅ浜匣蚝Y選功能使用更佳哦~）
三、差異參數(shù)任性調(diào)整
對(duì)于需要通過(guò)結(jié)果分析挑選關(guān)鍵基因的研究方向來(lái)說(shuō)，選擇合適的差異篩選條件對(duì)于基因的選擇是事半功倍的，但是往往合適的篩選條件需要多次的調(diào)整摸索，這時(shí)差異篩選條件的調(diào)整功能顯得尤為重要，CircRNA云平臺(tái)同樣支持在線完成差異參數(shù)的調(diào)整，基因數(shù)目太少、差異軟件不合適、參數(shù)設(shè)置不合理等問(wèn)題，通通可以調(diào)整！不限次、不限時(shí)，只需簡(jiǎn)單的點(diǎn)擊，輕松完成！
四、多個(gè)分組輕松比較
單一變量下的差異比較組結(jié)果往往無(wú)法證明相應(yīng)結(jié)論，所以往往會(huì)設(shè)置多個(gè)比較組，當(dāng)有多個(gè)差異比較組時(shí)，如何輕松篩選在各個(gè)集合間不同表達(dá)模式的基因顯得尤為重要，此時(shí)，韋恩圖扮演了重要的角色，通過(guò)不同比較組基因集合的韋恩圖，我們可以輕松獲得在任意比較組中特意表達(dá)或者在各個(gè)組合中共同表達(dá)的基因集合，CircRNA分析平臺(tái)分別配有基因表達(dá)韋恩圖（篩選不同樣本中特有或者共有表達(dá)基因集）以及差異表達(dá)韋恩圖（篩選不同差異分組中特有或者共有表達(dá)基因集），進(jìn)一步配合上下調(diào)基因的篩選，輕松找出有連續(xù)變化模式的基因集（這些基因可能是性狀相關(guān)的關(guān)鍵基因哦~
五、共表達(dá)分析助力數(shù)據(jù)挖掘
共表達(dá)分析常用于識(shí)別差異表達(dá)基因的共表達(dá)模式，分析各樣品間CircRNA表達(dá)豐度的不同變化模式，將相同表達(dá)趨勢(shì)的CircRNA劃分為一個(gè)數(shù)據(jù)集，通常我們認(rèn)為，具有相同表達(dá)變化趨勢(shì)的基因的功能互有關(guān)聯(lián)，所以通過(guò)分析CircRNA的共表達(dá)趨勢(shì)分析，可以進(jìn)一步篩選出項(xiàng)目中關(guān)鍵的基因集合。CircRNA分析平臺(tái)搭載了共表達(dá)分析個(gè)性化，簡(jiǎn)單的選擇基因集合以及樣本即可完成分析。
百邁客云平臺(tái)搭載的個(gè)性化功能，無(wú)需整理復(fù)雜的輸入文件、無(wú)需掌握晦澀的生信語(yǔ)言、不受時(shí)間空間的限制，只要有互聯(lián)網(wǎng)的地方，全年365天，全天24小時(shí)均能開(kāi)展數(shù)據(jù)挖掘，任何您靈感迸發(fā)的瞬間，都可以登陸平臺(tái)完成分析！目前轉(zhuǎn)錄調(diào)控全線全產(chǎn)品均已上云，完善的云服務(wù)模式深度助力提升客戶(hù)體驗(yàn)，更多好用的功能期待您的體驗(yàn)！
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