宏基因組Binning分析

宏基因組binning分析服務(wù)介紹

Binning指將宏基因組測序得到的混合了不同微生物的序列reads或序列組裝得到的contigs或scaffolds按物種分開歸類的過程。這些分開歸類的序列被稱為宏基因組組裝基因組（metagenome-assembled genomes，MAGs)。

宏基因組測的是一個環(huán)境中的全部微生物的基因組信息，以獲得群落中全部的物種信息和功能信息，而Binning可以把宏基因組數(shù)據(jù)中來自同一菌株的序列聚到一起，得到一個菌株的基因組，對不同的菌株進行分類鑒定。Binning分析使我們得以洞察這些無法在實驗室培養(yǎng)獲得的菌株的生態(tài)適應(yīng)機制、營養(yǎng)互作機制和新陳代謝功能等，可以研究在環(huán)境中起重要作用的微生物、進化機制、及其與宿主的互作機制等。

宏基因組binning分析流程

宏基因組binning分析結(jié)果展示

功能注釋分析

與常用數(shù)據(jù)庫（NR、KEGG、eggNOG、CAZy、CARD）進行比對，獲得基因功能信息并對各數(shù)據(jù)庫注釋情況進行統(tǒng)計。