現(xiàn)在,百邁客生物細(xì)菌基因組產(chǎn)品帶著五大核心升級重磅來襲,從樣本起始量到分析周期,從組裝方式到數(shù)據(jù)應(yīng)用,全方位打破行業(yè)瓶頸,為你的科研加速!
??很多時候,科研中的細(xì)菌樣本來之不易 —— 可能是臨床分離的少量病原菌,也可能是環(huán)境中富集的稀缺菌株,樣本量不足往往讓后續(xù)實(shí)驗(yàn) “卡殼”。此次百邁客生物 產(chǎn)品針對性優(yōu)化建庫技術(shù):
再也不用為 “樣本少” 發(fā)愁,讓每一份寶貴樣本都能發(fā)揮最大研究價值!?
傳統(tǒng)細(xì)菌基因組組裝常需依賴二代數(shù)據(jù)校正,不僅增加了實(shí)驗(yàn)成本,還延長了分析周期,流程銜接中也容易出現(xiàn)問題。
百邁客生物此次實(shí)現(xiàn)僅三代組裝技術(shù)突破:無需搭配二代數(shù)據(jù),僅憑三代長讀長優(yōu)勢,就能完成高質(zhì)量基因組組裝。更重要的是,我們已搭建好完備的純?nèi)治隽鞒?,從?shù)據(jù)下機(jī)到組裝結(jié)果輸出,全程標(biāo)準(zhǔn)化、自動化,無需你額外調(diào)試,拿到樣本即可啟動分析,大幅減少流程搭建的時間成本。
科研競爭講究 “時間就是成果”,漫長的分析周期往往會錯過最佳研究窗口。
百邁客生物通過技術(shù)優(yōu)化與流程重構(gòu),將細(xì)菌基因組項(xiàng)目的整體周期壓縮至低至 15 天—— 從樣本接收、建庫測序,到組裝分析、結(jié)果交付,全程高效推進(jìn),讓你更快拿到核心數(shù)據(jù),加速論文撰寫與項(xiàng)目結(jié)題。
“樣本做廢了”“數(shù)據(jù)沒出來”,是科研中最讓人崩潰的情況。百邁客生物深知實(shí)驗(yàn)可靠性的重要性,通過優(yōu)化樣本提取、建庫緩沖體系等關(guān)鍵環(huán)節(jié),將細(xì)菌基因組項(xiàng)目的整體成功率提升至≥95% ,顯著高于行業(yè)平均提取與實(shí)驗(yàn)成功率。
無論是復(fù)雜細(xì)胞壁結(jié)構(gòu)的細(xì)菌,還是低豐度樣本,我們都能最大限度保障實(shí)驗(yàn)成功,讓你的科研每一步都更穩(wěn)妥。
誰說數(shù)據(jù)分析不能又快又聰明?百邁客生物獨(dú)家提供個性化云上服務(wù),秒殺絕大多數(shù)同行!涵蓋六大功能,總有一款適合您:
百邁客生物打破這一局限,推出行業(yè)稀缺的個性化上云服務(wù),五大核心功能直擊研究痛點(diǎn),讓數(shù)據(jù)挖掘更高效、更精準(zhǔn)。
百邁客生物會將您的項(xiàng)目報告推送到您的云賬號下,在項(xiàng)目下可以直接進(jìn)行個性化分析,無需再整理復(fù)雜的文件表格進(jìn)行輸入,無生物學(xué)基礎(chǔ)亦可輕松拿捏基因組個性化分析。
1、通用數(shù)據(jù)庫注釋篩選
基于云平臺,你可根據(jù) “毒力基因”“耐藥基因”“代謝通路” 等研究關(guān)鍵詞,一鍵篩選目標(biāo)注釋結(jié)果,無需在海量數(shù)據(jù)中手動查找;
打分參數(shù)、可靠性參數(shù)設(shè)置,均可隨性設(shè)置。
2、基因組圖譜查詢
云平臺內(nèi)置【基因組圖譜展示工具】,點(diǎn)擊即可查看基因組環(huán)形圖、基因位置分布等信息,直觀掌握基因組結(jié)構(gòu)(示意圖如下)
3、T3SS分泌系統(tǒng)預(yù)測
基于EffectiveT3精準(zhǔn)預(yù)測III型分泌蛋白,致病機(jī)制研究更深入!
4、GTDB-tk分類鑒定
輸入細(xì)菌基因組序列,即可通過該工具完成物種分類,明確菌株進(jìn)化地位
5、ANI分析
快速計(jì)算基因組間相似性,可選多參考基因組比對,并生成熱圖,物種界定更輕松!
6、SNP進(jìn)化樹構(gòu)建
物種進(jìn)化樹(?稱系統(tǒng)發(fā)育樹或?命樹)是?物學(xué)中?來描述不同物種或?物類群之間演化關(guān)系的樹狀圖。它通過分?結(jié)構(gòu)展示物種的分化過程、共同祖先及親緣關(guān)系的遠(yuǎn)近。使?snippy軟件進(jìn)?core snp 分析,基于樣本間的core snp ,使?phmyl構(gòu)建進(jìn)化樹,展示?標(biāo)物種與給定的菌株之前的近緣關(guān)系。
用 snippy 篩選核心 SNP,結(jié)合 phmyl 構(gòu)建進(jìn)化樹,清晰展示目標(biāo)菌株與參考菌株的親緣關(guān)系,助力溯源與進(jìn)化分析。
從 “能做” 到 “做好”,從 “出數(shù)據(jù)” 到 “出成果”,百邁客生物細(xì)菌基因組產(chǎn)品始終以研究者需求為核心,不斷迭代升級。此次五大升級已全面落地,后續(xù)還將推出更多貼合科研場景的功能,為你的細(xì)菌研究提供更強(qiáng)大的技術(shù)支撐!
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純?nèi)?vs 混合組裝的硬核數(shù)據(jù)對比(基于實(shí)測菌株組裝結(jié)果)
注意:組裝序列條數(shù)>1的為質(zhì)粒個數(shù)
傳統(tǒng)混合組裝依賴二代數(shù)據(jù)糾錯,而百邁客優(yōu)化算法直接解析三代長讀長數(shù)據(jù),顯著縮短周期、降低成本。
菌株菌實(shí)現(xiàn)完美環(huán)狀染色體閉合。
BUSCO完整性>99% + 污染率≤0.08%,達(dá)到國際參考基因組標(biāo)準(zhǔn)。